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    城市環境研究所在人為活動對土壤抗性組的影響機制方面取得進展

    文章來源:城市環境研究所  |  發布時間:2022-10-27  |  【打印】 【關閉

      

      近日,中國科學院城市環境研究所朱永官院士團隊蘇建強研究組在環境健康領域期刊Environment International發表了題為“Metagenomic and viromic analysis reveal the anthropogenic impacts on the plasmid and phage borne transferable resistome in soil”的研究論文。該論文利用宏基因組和病毒組技術在reads和contigs水平系統解析了不同土地利用類型下土壤抗性組中高風險抗性基因及其驅動因子。 

      抗生素抗性基因(ARGs)在全球環境中分布廣泛且歷史悠久,土壤作為儲存ARGs最重要的庫之一,其不同環境中的ARGs組成和豐度已有大量研究,但對潛在健康風險抗性基因及其驅動因子的解析較為缺乏。本文構建了一個利用宏基因組數據探明環境高風險抗性基因及其載體的流程(圖1),揭示了農業區是臨床性ARGs的熱區,質粒是介導人源ARGs向環境轉移的主要載體,并且其中大多數為臨床性ARGs。通過對病毒組的分析則表明土壤噬菌體基因組極少攜帶抗性基因,但可能通過轉導促進ARGs的擴散。 

      中國科學院城市環境研究所博士生廖虎為該研究第一作者,蘇建強研究員為通訊作者。本研究得到了國家重點研發計劃(No. 2020YFC1806902),國家自然科學基金(No. 42021005)等項目的資助。

      論文鏈接

    圖1 高風險抗性基因及其載體的解析流程

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