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    營養與健康所王澤峰研究組發表一種不依賴于gRNA的新型RNA精準編輯系統

    文章來源:上海營養與健康研究所  |  發布時間:2022-08-30  |  【打印】 【關閉

      
      2022年8月27日,中國科學院上海營養與健康研究所的王澤峰團隊在Nucleic Acids Research雜志發表長文Programmable RNA base editing with a single gRNA-free enzyme。該研究報道了一種單一組分的新型可編程RNA單堿基編輯系統REWIRE(RNA editing with individual RNA-binding enzyme),可以在人體細胞中實現高達60%-80%的A-to-I或C-to-U編輯。該系統利用一種人源PUF蛋白來靶向識別RNA序列。PUF蛋白包含一個RNA結合域,稱為Pumilio同源域或PUF域,這個RNA結合域通常由八套36個氨基酸的重復序列組成。每個重復序列上有三個氨基酸殘基在和RNA的結合中起重要作用。通過對可編程PUF結構域的設計和對其長度的優化,該系統可以實現對8-10nt的目標序列精準定位高效編輯靶標的同時降低脫靶效應。

      總體而言,REWIRE提供了一種無需借助gRNA的單一人源蛋白組分RNA單堿基平臺,其精確定位、低脫靶效應的特點為生命科學領域的研究帶來更多可能。研究者還將REWIRE與已有的基于CRISPER/Cas的REPAIR編輯策略進行綜合評比,指出REWIRE在脫靶率相當時的編輯效率具有明顯優勢,因此未來的應用前景更加廣闊。目前,該研究團隊也在探索后續轉化研究的可能,以期為一些目前臨床需求迫切且尚無應對策略的遺傳性疾病提供新的治療思路。

      中國科學院上海營養與健康研究所韓文建博士(現中科院腦科學與智能技術卓越創新中心博士后)與博士研究生黃文娣為該論文的共同第一作者,茅繆偉博士和王澤峰研究員為該論文的共同通訊作者。該研究工作得到了國家自然科學基金委、科技部國家重點研發計劃、中科院先導專項、浙江大學上海高等研究院繁星科學基金、上海市科委、中科院百人計劃、博新計劃以及上海市超級博士后激勵計劃等資助。

      文章鏈接:https://academic.oup.com/nar/advance-article/doi/10.1093/nar/gkac713/6677559?guestAccessKey=e3e1a6d8-ea59-47b8-8d9f-391b33f104ba

       

      圖:REWIRE系統及其優化策略

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